研究报告

当归抽薹关键基因 FT 和 SOC1 的生物信息学分析  

樊世婷1 , 李云2 , 罗香怡1 , 宗渊2 , 刘宝龙2 , 李建民1
1 青海师范大学生命科学学院, 西宁, 810008; 2 中国科学院西北高原生物研究所, 青海省作物分子育种重点实验室, 西宁, 810001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2020年07月24日    接受日期: 2020年08月06日    发表日期: 2023年01月31日
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摘要

当归是一种药用价值较高的重要的多年生草本大宗药材,但当归抽薹严重影响其产量和品质,这是限制大规模人工种植栽培当归的关键瓶颈。本研究从当归中克隆到 FT 和 SOC1 两个候选基因,并通过序列同源比对分析候选基因与当归抽薹的关联性。结果表明,FT 基因全长为 528 bp,编码 175 个氨基酸,生物信息学分析显示,FT 蛋白属于不稳定蛋白,在膜外进行作用,主要二级结构形式为延伸链和无规卷曲。SOC1 基因共 654 bp,编码 217 个氨基酸,生物信息学分析显示,SOC1 蛋白属于不稳定蛋白,主要二级结构形式为α- 螺旋和无规则卷曲。发育树聚类显示本研究克隆的 FT 基因编码的氨基酸序列与胡萝卜FT 基因编码的氨基酸序列和胡萝卜亚种栽培种‘heading date 3A-like’蛋白的氨基酸序列均有较高同源性。SOC1基因编码的蛋白与胡萝卜亚种栽培种 MADS-box 基因家族中 SOC1 类似蛋白有较高的同源性。综上推测本研究中分离出的 FT 和 SOC1 两个基因很有可能与当归开花性状密切相关。本研究结果对解析当归抽薹相关分子机制提供理论参考,为当归的改良育种提供分子依据。

关键词
当归(A ngelica sinensis);FT;SOC1;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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